法律分析：
员工在合同期间的癌症处理如下：
(1)企业职工因病或非因工伤需要停止工作医疗时，根据本人实际工作年限和在本单位工作年限，给予三至二十四个月的医疗期；
(二)不能从事原工作或者用人单位单独安排的工作的，由劳动鉴定委员会进行劳动能力鉴定。
工作期间得癌症是工伤吗？
工作期间癌症是否为工伤，取决于情况：
1、若该病与工作原因无关，则不属于工伤；
2、如果怀疑与工作原因有关，可以向当地卫生部门报告申请职业病鉴定的情况，即使是工伤。
法律依据：
《中华人民共和国劳动合同法》
第四十二条劳动者有下列情形之一的，用人单位不得依照本法第四十条、第四十一条的规定解除劳动合同：
（一）从事接触职业病危害作业的劳动者未进行离岗前职业健康检查，或者疑似职业病病人在诊断或者医学观察期间的；
（二）在本单位患职业病或者因工负伤并被确认丧失或者部分丧失劳动能力的；
（三）患病或者非因工负伤，在规定的医疗期内的；
（四）女职工在孕期、产期、哺乳期的；
（五）在本单位连续工作满十五年，且距法定退休年龄不足五年的；
（六）法律、行政法规规定的其他情形。